Cell
May 01, 2025
Les génomes bactériens et viraux des racines des cultures révèlent des espèces et des modèles de microbiome inexplorés
Rui Dai,1,2,3,4,11 Jingying Zhang,2,3,11 Fang Liu,1,11 Haoran Xu,1,3,4 Jing-Mei Qian,1,3,4 Shani Cheskis,5 Weidong Liu,1,3,4 Binglei Wang,2 Honghui Zhu,6 Lotte J.U. Pronk,7 Marnix H. Medema,7 Ronnie de Jonge,8,9 Corne´ M.J. Pieterse,8 Asaf Levy,5 Klaus Schlaeppi,10 and Yang Bai2,3,12,*
1 Institut de génétique et de biologie du développement, Académie chinoise des sciences, Pékin 100101, Chine
2 Centre Pékin-Tsinghua pour les sciences de la vie, Laboratoire clé d'État de recherche sur la fonction et la modulation des gènes, Programme d'études supérieures Pékin-Tsinghua-NIBS, École des sciences de la vie, Université de Pékin, Pékin 100871, Chine
3 CAS-JIC Centre d'excellence pour les sciences végétales et microbiennes, Institut de génétique et de biologie du développement, Académie chinoise des sciences, Pékin 100101, Chine
4 Collège des sciences agricoles avancées, Université de l'Académie chinoise des sciences, Pékin 100101, Chine
5 Département de phytopathologie et de microbiologie, Institut des sciences de l'environnement, Faculté d'agriculture, d'alimentation et d'environnement, Université hébraïque de Jérusalem, Rehovot, Israël
6 Laboratoire clé d'État de microbiologie appliquée de Chine du Sud, Institut de microbiologie, Académie des sciences du Guangdong, Guangzhou 510070, Chine
7 Groupe de bioinformatique, Université et recherche de Wageningen, 6708 PB Wageningen, Pays-Bas
8 Interactions plantes-microbes, Département de biologie, Science for Life, Université d'Utrecht, 3584 CH Utrecht, Pays-Bas
9 Technologie de l'IA pour la vie, Département des sciences de l'information et de l'informatique, Science pour la vie, Université d'Utrecht, 3584 CC Utrecht, Pays-Bas
10 Département des sciences de l'environnement, Université de Bâle, Bâle 4056, Suisse
11 Ces auteurs ont contribué de manière égale
12 contacts principaux
| 10.1016/j.cell.2025.02.013 |
10.1016/j.cell.2025.02.01310.1016/j.cell.2025.02.01310.1016/j.cell.2025.02.013 External LinkExternal Link
Dans ce numéro de Cell, Dai et al. construisent des collections complètes de génomes bactériens et viraux à partir de racines de cultures. Ils identifient les fonctions bactériennes conservées, enrichies dans les microbiomes racinaires de différents sols et espèces hôtes, ainsi que les interactions bactéries-virus dans les écosystèmes racinaires des cultures. L'image de couverture représente le microbiome racinaire des cultures comme la « matière noire » de l'univers, symbolisant l'effort scientifique visant à décoder les aspects cachés des écosystèmes racinaires. Source de l'image : Binglei Wang et Yang Bai.
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