Nucleic Acids Research Service de conception de couvertures de journaux (NEMO-TOC)

 Nucleic Acids Research

11 July 2022

Un algorithme de regroupement de transformation et son application dans le profilage structurel des polyribosomes

Wenhong Jiang¹, Jonathan Wagner^2,3, Wenjing Du¹, Juergen Plitzko⁴, Wolfgang Baumeister², Florian Beck⁴ and Qiang Guo^1,5

10.1093/nar/gkac547

Les améliorations apportées à la préparation des échantillons par cryo-tomographie électronique, aux instruments de microscopie électronique et aux algorithmes de traitement d'images ont fait progresser l'analyse structurelle des macromolécules in situ. Au-delà de ces analyses de macromolécules individuelles, l’étude de leurs interactions avec des voisins fonctionnellement liés dans des habitats cellulaires surpeuplés, c’est-à-dire la « sociologie moléculaire », revêt une importance fondamentale en biologie. Nous présentons ici un algorithme NEMO-TOC (NEighboring Molecule TOpology Clustering). Nous avons optimisé cet algorithme pour la détection et le profilage des polyribosomes, qui jouent à la fois des rôles constitutifs et régulateurs dans l'expression des gènes. Nos résultats suggèrent un modèle dans lequel les polysomes sont formés en connectant plusieurs blocs non stochastiques, dans lequel la traduction est probablement synchronisée.